Vers une cartographie des 37 000 milliards de cellules du corps humain

cellules corps humain
Cette photo montre le squelette d'un fœtus en développement, dans lequel le cartilage (violet) sert d'échafaudage pour l'os (bleu) qui viendra plus tard. Crédits : A. Chédotal & R. Blain, Institut de la Vision, Paris & MeLiS UCBL HCL, Lyon

Imaginez que l’on puisse dresser une carte détaillée de chacune des cellules qui composent notre corps, un peu comme un Google Maps biologique. C’est exactement ce que cherche à accomplir le projet Human Cell Atlas (HCA), un programme scientifique international ambitieux qui pourrait transformer la médecine et notre compréhension du corps humain. Avec des résultats impressionnants déjà publiés, ce projet est une étape majeure dans l’histoire des sciences biomédicales.

Pourquoi cartographier les cellules du corps humain ?

Le corps humain est composé de 36 à 37 trillions de cellules (soit 36 à 37 000 milliards de cellules), réparties en une multitude de types cellulaires aux rôles divers. Cependant, leur localisation précise et leurs interactions restent mal comprises. L’objectif du Human Cell Atlas est donc de créer une carte complète de ces cellules en identifiant leur emplacement, leur identité et leur fonction. Ce travail monumental pourrait aider les chercheurs à mieux comprendre comment nos tissus et nos organes fonctionnent ainsi que les mécanismes des maladies.

Pour rendre cette idée plus accessible, comparez-la à l’évolution de la cartographie géographique : nous sommes passés de cartes sommaires du monde, comme celles du quinzième siècle, à des outils modernes tels que Google Maps. Ces derniers offrent des vues détaillées, des topographies précises et des données en temps réel comme les schémas de circulation. De la même manière, le Human Cell Atlas vise à transformer notre compréhension grossière de la biologie humaine en une vision d’une précision inédite.

Un projet à échelle planétaire

Pour réaliser cet exploit, le consortium international du HCA rassemble des scientifiques de plus de 100 pays. Ensemble, ils ont déjà analysé 100 millions de cellules prélevées sur plus de 10 000 personnes à travers le monde en intégrant une diversité de contextes génétiques et démographiques. Et ce projet n’en est qu’à ses débuts. D’ici 2026, les chercheurs prévoient de présenter une première version de leur atlas qui sera enrichie au fil des années avec des milliards de nouvelles données.

Le projet s’appuie sur des technologies de pointe comme le séquençage unicellulaire qui permet d’analyser les caractéristiques individuelles de chaque cellule. Ces avancées technologiques nécessitent également des outils informatiques sophistiqués pour traiter et interpréter d’immenses volumes de données.

cellules
Un instantané du tissu pulmonaire humain. Crédits : Nathan Richoz, Université de Cambridge

Des découvertes déjà révolutionnaires sur nos cellules

Les efforts du HCA ont déjà permis des avancées scientifiques impressionnantes, publiées dans une série de 40 articles dans des revues de référence. Voici quelques-unes des découvertes majeures.

Le tube digestif et les maladies inflammatoires

L’équipe a cartographié 1,1 million de cellules qui proviennent du tube digestif, de l’œsophage au côlon en utilisant des échantillons de près de 190 personnes. En comparant des tissus sains et malades, notamment chez des patients atteints de colite ulcéreuse ou de maladie de Crohn, les chercheurs ont identifié un type de cellule qui contribue à l’inflammation chronique. Ces cellules semblent en effet attirer les cellules immunitaires et déclencher un cercle vicieux inflammatoire. Cette découverte ouvre ainsi de nouvelles pistes pour le traitement des maladies inflammatoires de l’intestin.

cellules
Ces vaisseaux sanguins se trouvent dans une partie de l’intestin grêle appelée iléon. Crédits : Ana-Maria Cujba, Catherine Tudor et Rasa Elmentaite

Le développement prénatal

Un autre volet de l’étude s’est concentré sur les premiers stades de développement humain. Les chercheurs ont exploré comment le placenta se forme et comment les cellules du squelette s’organisent pour créer le crâne dès le premier trimestre de grossesse. Ces travaux ont révélé des états cellulaires jusqu’alors inconnus ainsi que des gènes impliqués dans des anomalies comme la craniosynostose, une maladie congénitale où les os du crâne fusionnent prématurément.

cellules
Un atlas multiomique du développement squelettique précoce humain. Crédits : K. To, L. Fei, JP Pett, et coll. (2024)

Les organoïdes : mini-organes en laboratoire

Les scientifiques du HCA ont également étudié des organoïdes, ces répliques miniatures d’organes humains cultivées en laboratoire. Par exemple, ils ont comparé des organoïdes cérébraux au développement réel du cerveau humain et ont constaté que ces modèles reflètent fidèlement le cerveau fœtal jusqu’au deuxième trimestre de grossesse. De telles découvertes permettent d’améliorer la fabrication d’organoïdes et d’explorer des questions biologiques impossibles à étudier sur des sujets humains.

« Les organoïdes ne se contentent pas de modéliser des organes, ils nous donnent aussi des informations sur les mécanismes internes du corps », explique Sarah Teichmann, co-présidente de l’HCA. Par exemple, les chercheurs peuvent tester des médicaments ou simuler des maladies dans ces structures artificielles, ce qui pourrait révolutionner la recherche biomédicale.

Un outil inestimable pour l’avenir

Les applications potentielles du Human Cell Atlas sont immenses.

  • Identifier les tissus vulnérables : lors de la pandémie de COVID-19, des travaux antérieurs du HCA ont révélé des tissus particulièrement sensibles au virus. Ces informations ont été cruciales pour comprendre les formes graves de la maladie.
  • Étudier les maladies rares : en cartographiant les cellules normales, les chercheurs peuvent repérer des anomalies responsables de maladies génétiques rares ou complexes.
  • Explorer l’évolution : en comparant l’atlas humain à d’autres espèces, les scientifiques pourraient élucider les mystères de notre évolution.

À terme, l’atlas servira de ressource mondiale pour guider la recherche médicale et découvrir des aspects du corps humain que nous ne pouvons pas encore imaginer.

Le Human Cell Atlas représente ainsi bien plus qu’un projet scientifique : c’est une étape déterminante vers une médecine personnalisée et une compréhension approfondie de la biologie humaine. Bien que ce projet colossal soit encore en cours, il a déjà commencé à transformer la manière dont nous percevons le corps humain et ses dysfonctionnements. En cartographiant les trillions de cellules qui nous composent, les chercheurs ouvrent la voie à une nouvelle ère où les traitements seront mieux ciblés, les maladies mieux comprises, et la vie humaine mieux protégée.